R-Shiny aplicações para modelização de vigilância e controlo vectorial

Detalhes do Projeto

Ano: 2021-2022

Cliente: Epiconcept para o Centro Europeu de Prevenção e Controlo das Doenças

Objetivo: Melhoria de duas aplicações de modelização R Shiny para apoiar o processo de tomada de decisão para a vigilância e controlo vectorial da dengue, chikungunya, Zika e doenças do Vírus do Nilo Ocidental.

Entregas:

  • Melhoria da segurança da aplicação AedesRisk, outputs, e gestão de erros e registos.
  • Aplicação VeCa MATLAB traduzida numa aplicação R-Shiny com melhor segurança, outputs, e erros e gestão de logs.
  • Guias do utilizador actualizados.

Atividades realizadas

O Centro Europeu de Prevenção e Controlo das Doenças tinha desenvolvido duas aplicações de modelização para apoiar o processo de tomada de decisões em matéria de vigilância e controlo vectorial:

  • A aplicação AedesRisk R-Shiny para a dengue, chikungunya, e a doença do vírus Zika.
  • A aplicação MATLAB Vector Control Analysis (VeCa) para a infecção pelo vírus do Nilo Ocidental.

Acrescentámos as seguintes funcionalidades à aplicação AedesRisk existente (Figura 1):

  • Bloqueio do acesso aos bots.
  • Verificação automatizada dos ficheiros inseridos e gestão melhorada de erros e registos.
  • Melhoria da gestão da memória do modelo de cálculo.
  • Estimativas de intervalos de previsão adicionadas aos resultados das simulações.
Aplicação AedesRisk R-Shiny

Figure 1. Aplicação AedesRisk R-Shiny (Disponível em: https://shinyapps.ecdc.europa.eu/shiny/AedesRisk/ )

Traduzimos a aplicação VeCa MATLAB existente numa aplicação R-Shiny e acrescentámos as funcionalidades desenvolvidas para a aplicação AedesRisk.

Actualizámos os guias do utilizador de ambas as ferramentas adicionando um caso de estudo à aplicação VeCa (Figura 2).

Caso de estudo da aplicação VeCa

Figure 2. Caso de estudo da aplicação VeCa