Alexandre Blake, MD, MSc

Profil

Médecin spécialiste de santé publique avec une expertise en épidémiologie de terrain.

Douze ans d’expérience professionnelle dans des instituts de recherche, et organisations gouvernementales et non-gouvernementales.

Expérience professionnelle

Depuis Juillet 2024: Post-doctorant, Human Infectious Disease Lab Center - Penn State University - State College, Etats-Unis d’Amerique

  • Inférence de la mobilité saisonnière de la population dans le sud de la République démocratique du Congo en utilisant l’analyse spatiale et d’accessibilité.

  • Estimation de la transmission des maladies dans le sud de la République démocratique du Congo, plus particulièrement le choléra et la rougeole.

Depuis Juin 2020: Médecin spécialiste de santé publique, Sigia - Porto, Portugal

Pour l’Organisation Mondiale de la Santé (Siège, Bureau Régional de l’Afrique, Bureau Régional de l’Europe, Bureau Pays Kirghizistan) :

  • 2023 - Mise à jour et digitalisation d’un outil d’évaluation des capacités nationales de surveillance et réponse, y compris dans un contexte d’urgence.
  • 2021 - Développement de deux tableaux de bord interactifs R-Shiny pour le suivi du Plan stratégique de préparation et de réponse de l’OMS au COVID-19.
  • 2021 - Revue interne de la réponse de l’OMS aux 9e, 10e, 11e et 12e épidémies d’Ebola en République Démocratique du Congo.
  • 2021 - Soutien au centre d’opérations d’urgence en santé publique du Kirghizstan au travers de procédures opérationnelles standardisées et d’une plateforme épidémiologique intégrée.
  • 2020 - Développement d’un tableau de bord interactif de suivi d’indicateurs clés de l’épidémie de COVID-19 pour le ministère de la Santé du Kirghizstan et cartographie du système d’information en santé.
  • 2020 - Développement d’un tableau de bord interactif pour la collecte, la visualisation, et l’analyse de données obtenues par un outil stratégique d’évaluation des risques de l’OMS (outil STAR).

Pour le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies au travers de Epiconcept :

  • 2022 - Amélioration de deux applications de modélisation R Shiny de soutien au processus décisionnel pour la surveillance et la lutte antivectorielle.

08/2018 - 06/2024: Département de Biologie de l’Université de Penn State - State College, Etats-Unis d’Amerique

Thèse de science dans le département de Biologie dans l’université de Penn State, State College, Etats-Unis d’Amérique Thèse sur l’impact des mouvements de population sur la dynamique des maladies infectieuses.

  • Analyse en vaguelette des données de surveillance de la rougeole de 1995 à 2004 au Niger et investigation de l’influence de la pluviométrie du fait des mouvements saisonniers associés au cycle agricole.

  • Modélisation de la phase précoce de l’épidémie de choléra à Haïti en 2010, et de l’impact du tremblement de terre et des mouvements de panique au début de l’épidémie sur la transmission de la maladie.

09/2015 - 07/2018: Epicentre - Paris, France

  • Participation à la collecte de données sur l’étude d’efficacité vaccinale pendant l’épidémie d’Ebola dans la province Equateur, RDC, faite par Médecins Sans Frontières.

  • Enquête de couverture vaccinale des deux campagnes de vaccination contre le choléra par Euvichol dans les communes de Chardonnières, Côteaux, et Port-à-Piment, dans le département du Sud à Haïti en 2017.

  • Recrutement de l’échantillon d’une enquête de cohorte sur l’efficacité vaccinale du vaccin Shanchol lors de l’épidémie de choléra à Lusaka, Zambie, en 2016.

  • Evaluation d’un score de prédiction de la survenue d’une épidémie de rougeole en RDC.

  • Co-investigateur principal d’une enquête cas-témoin sur l’efficacité vaccinale du vaccin Shanchol à Kalémie en 2016, une zone endémique du choléra en RDC.

  • Mise en place d’un rapport automatisé sur l’épidémie de rougeole pour les sections Française, Suisse, et Belge de Médecins Sans Frontières en 2016-2017 en RDC intégrant un score de prédiction.

  • Soutien épidémiologique à la réponse de Médecins Sans Frontière à l’épidémie de rougeole au Katanga, République Démocratique du Congo (RDC), de 2015 :

  • Prise de contact avec les autorités sanitaires du Katanga pour accès aux données officielles.
  • Coordination avec interactions avec les sections Française, Suisse, Hollandaise, Espagnole, et Belge présentes en RDC.
  • Mise en place d’un rapport hebdomadaire faisant un point sur l’épidémie de rougeole au Katanga partagé avec les sections MSF et les autorités sanitaires.

11/2014 - 08/2015: Agence de Médecine Préventive - Paris, France

  • Soutien épidémiologique aux pays membres du réseau Africhol dans l’analyse des données de surveillance du choléra.

  • Aide à l’adaptation et la mise en place d’un système de surveillance par le Département de Prévention et de Lutte des Maladies Infectieuse adapté à la crise Ebola en Guinée.

  • Contrôle qualité; du recueil des données de surveillance de 2011 à 2013 dans les districts de Kasese et Mbale, Ouganda.

05/2014 - 10/2014: UMR 196 - Programme de prévention et de traitement du VIH - Chiang Mai, Thailand

Aide au suivi des femmes de l’étude PapilloV avec :

  • Soutien hebdomadaire des Assistants de Recherche Clinique avec évaluations individuelles régulières.

  • Evaluation régulière du suivi sur les 24 centres recruteurs à travers toute la Thaïlande.

  • Rapports réguliers aux bailleurs de fonds.

11/2013 - 04/2014: Unité d’Epidémiologie des Maladies Emergentes à l’Institut Pasteur - Paris, France

  • Participation à une revue de littérature sur la séroprévalence de l’hépatite C en Afrique.

  • Participation à l’écriture d’un article sur les encéphalites à entérovirus au Vietnam.

  • Participation à la rédaction d’un protocole sur une étude cas témoin sur l’imputabilité de syndromes de Guillain-Barré au virus Zika en Polynésie française.

  • Gestion de la saisie des données du cas témoin et d’enquêtes purement descriptives sur les cas suspects de complications de l’infection au Zika.

  • Participation à la mise en place et au recueil des données du cas témoin sur l’épidémie de Zika en collaboration avec le Bureau de Veille Sanitaire en Polynésie française.

10/2013: Agence de Médecine Préventive - Paris, France

Analyse de données du réseau Africhol :

  • Analyse des données du ministère de la Santé de Guinée de l’épidémie de choléra à Conakry en 2012, création de chloropleths avec évolution des taux d’incidence hebdomadaires, taux d’attaque, et SMR avec lissage par estimateur local de Marshall par quartier, analyse de la dynamique spatio-temporelle avec recherche de clusters spatio-temporels à l’échelle des quartiers par SaTScan.

  • Analyse descriptive des données Africhol sur les facteurs de risques relevés, les données microbiologiques

05/2013 - 10/2013: Département des Maladies Infectieuses à l’InVS (maintenant Santé Publique France) - Paris, France

  • Participation à l’analyse descriptive des infections urinaires communautaires dans le cadre de l’étude DRUTI avec Bruno Coignard et Sophie Vaux, et présentation des résultats préliminaires au congrès de la RICAI en novembre 2013, et participation à la rédaction du rapport pour la DGS.

  • Description du système de surveillance de surveillance métropolitain du Chikungunya et de la Dengue avec Marie-Claire Paty, et Harold Noël.

  • Participation à l’enquête de suivi des contacts du 2e cas de MERS-CoV Français.

  • Participation au suivi des signalements des cas potentiels de MERS-Cov.

11/2012 - 04/2013: Agence de Médecine Préventive - Paris, France

  • Etude de la qualité diagnostique de la PCR temps réel lytA sur sang total dans le diagnostic de l’étiologie pneumococcique dans les pneumonies dans le district de Tône au Togo avec usage d’analyse de classes latentes avec Jennifer Moïsi.

  • Participation au soutien de l’équipe multidisciplinaire d’Azerbaïdjan dans l’analyse médico-économique de l’introduction du vaccin conjugué pneumococcique en utilisant le modèle TRIVAC dans le cadre de l’initiative ProVac IWG avec Julia Blau.

05/2011 - 10/2011: U1018 à l’InSERM avec Bertran Auvert - Paris, France

  • Participation à des démarches de demande de financement.

  • Analyse d’une base de données sur l’impact de la circoncision sur la prévalence du VIH à Orange Farm.

  • Contrôle qualité des données et participation à la finalisation d’un questionnaire à Johannesburg.

11/2010 - 04/2011: Epicentre - Paris, France

  • Participation à la rédaction du protocole de l’enquête de couverture de la vaccination par le MenAfriVac au Niger.

  • Participation à la rédaction du protocole d’une enquête cas témoin sur les facteurs de risque d’infection du choléra à Gonaïves en Haïti.

  • Participation à la formation des équipes d’enquêteurs de l’enquête cas témoin et au recueil des données à Gonaïves.

05/2010 - 10/2010: Laboratoire Santé, Environnement, et Vieillissement de l’hôpital Sainte-Périne - Paris, France

  • Analyse de la base de données BVA sur les aidants informels.

  • Présentation orale sur les différences liées au sexe chez les aidants informels à l’IAGG 2011.

11/2009 - 04/2010: Unité de Recherche Clinique de l’hôpital La Pitié Salpêtrière - Paris, France

  • Apprentissage et mise en pratique de l’analyse univariée et multivariée des variables qualitatives, quantitatives, et censurées.

  • Apprentissage du nettoyage d’une base de données.

Formation

  • Doctorat en biologie à Penn State University (2023). Thèse sur l’impact des mouvements de population sur la dynamique des maladies infectieuses.

  • Doctorat en médecine avec spécialisation en Santé Publique à l’université de Paris XI (2014). Thèse Médicale sur une analyse spatiale du choléra à Gonaives et Carrefour, Haïti.

  • MSc d’Epidémiologie, à la London School of Hygiene and Tropical Medicine.

Langues parlées

  • Français: langue maternelle. Anglais: courant.

Compétences informatiques

  • R statistical software, epidata

Autres activités

Réserviste dans la Réserve Sanitaire Française

Publications scientifiques

Ferreras E, Matapo B, Chizema-Kawesha E, Chewe O, Mzyece H, Blake A, Moonde L, Zulu G, Poncin M, Sinyange N, Kasese-Chanda N, Phiri C, Malama K, Mukonka V, Cohuet S, Uzzeni F, Ciglenecki I, Danovaro-Holliday MC, Luquero FJ, Pezzoli L. Delayed second dose of oral cholera vaccine administered before high-risk period for cholera transmission: Cholera control strategy in Lusaka, 2016. PLoS One. 2019 Aug 30;14(8):e0219040. doi: 10.1371/journal.pone.0219040. eCollection 2019. PubMed PMID: 31469853; PubMed Central PMCID: PMC6716633.

Keating P, Carrion Martin AI, Blake A, Lechevalier P, Uzzeni F, Gignoux E, Okonta C, Langendorf C, Smit S, Ahuka S, Suchard M, Pukuta E, Degail MA, Hansen L, Kibanza- Kyungu J, Ciglenecki I, Cohuet S. Measles seroprevalence after reactive vaccination campaigns during the 2015 measles outbreak in four health zones of the former Katanga Province, Democratic Republic of Congo. BMC Public Health. 2019 Aug 22;19(1):1153. doi: 10.1186/s12889-019-7500-z. PubMed PMID: 31438898; PubMed Central PMCID: PMC6704676.

Mwaba J, Ferreras E, Chizema-Kawesa E, Mwimbe D, Tafirenyika F, Rauzier J, Blake A, Rakesh A, Poncin M, Stoitsova S, Kwenda G, Azman AS, Chewe O, Serafini M, Lukwesa- Musyani C, Cohuet S, Quilici ML, Luquero FJ, Page AL. Evaluation of the SD bioline cholera rapid diagnostic test during the 2016 cholera outbreak in Lusaka, Zambia. Trop Med Int Health. 2018 Aug;23(8):834-840. doi: 10.1111/tmi.13084. Epub 2018 Jun 29. PubMed PMID: 29851181.

Massing LA, Aboubakar S, Blake A, Page AL, Cohuet S, Ngandwe A, Mukomena Sompwe E, Ramazani R, Allheimen M, Levaillant P, Lechevalier P, Kashimi M, de la Motte A, Calmejane A, Bouhenia M, Dabire E, Bompangue D, Kebela B, Porten K, Luquero F. Highly targeted cholera vaccination campaigns in urban setting are feasible: The experience in Kalemie, Democratic Republic of Congo. PLoS Negl Trop Dis. 2018 May 7;12(5):e0006369. doi: 10.1371/journal.pntd.0006369. eCollection 2018 May. PubMed PMID: 29734337; PubMed Central PMCID: PMC5957443.

Blake A, Keita VS, Sauvageot D, Saliou M, Njanpop BM, Sory F, Sudre B, Lamine K, Mengel M, Gessner BD, Sakoba K. Temporo-spatial dynamics and behavioural patterns of 2012 cholera epidemic in the African mega-city of Conakry, Guinea. Infect Dis Poverty. 2018 Feb 15;7(1):13. doi: 10.1186/s40249-018-0393-8. PubMed PMID: 29448965; PubMed Central PMCID: PMC5815196.

Ferreras E, Chizema-Kawesha E, Blake A, Chewe O, Mwaba J, Zulu G, Poncin M, Rakesh A, Page AL, Stoitsova S, Voute C, Uzzeni F, Robert H, Serafini M, Matapo B, Eiros JM, Quilici ML, Pezzoli L, Azman AS, Cohuet S, Ciglenecki I, Malama K, Luquero FJ. Single- Dose Cholera Vaccine in Response to an Outbreak in Zambia. N Engl J Med. 2018 Feb 8;378(6):577-579. doi: 10.1056/NEJMc1711583. PubMed PMID: 29414267.

Munier A, Njanpop-Lafourcade BM, Sauvageot D, Mhlanga RB, Heyerdahl L, Nadri J, Wood R, Ouedraogo I, Blake A, Akilimali Mukelenge L, Anné JB, Banla Kere A, Dempouo L, Keita S, Langa JPM, Makumbi I, Mwakapeje ER, Njeru IJ, Ojo OE, Phiri I, Pezzoli L, Gessner BD, Mengel M. The African cholera surveillance network (Africhol) consortiummeeting, 10-11 June 2015, Lomé, Togo. BMC Proc. 2017 Jan 31;11(Suppl 1):2. doi: 10.1186/s12919-016-0068-z. eCollection 2017. PubMed PMID: 28813542; PubMed Central PMCID: PMC5301166.

Delory T, Ngo-Giang-Huong N, Rangdaeng S, Chotivanich N, Limtrakul A, Putiyanun C, Suriyachai P, Matanasarawut W, Jarupanich T, Liampongsabuddhi P, Heard I, Jourdain G, Lallemant M, Le Coeur S; PapilloV study group. Human Papillomavirus infection and cervical lesions in HIV infected women on antiretroviral treatment in Thailand. J Infect. 2017 May;74(5):501-511. doi: 10.1016/j.jinf.2017.02.007. Epub 2017 Feb 28. PubMed PMID: 28254419.

Rossignol L, Vaux S, Maugat S, Blake A, Barlier R, Heym B, Le Strat Y, Blanchon T, Hanslik T, Coignard B. Incidence of urinary tract infections and antibiotic resistance in the outpatient setting: a cross-sectional study. Infection. 2017 Feb;45(1):33-40. doi: 10.1007/s15010-016-0910-2. Epub 2016 May 27. PubMed PMID: 27234045.

Blake A, Njanpop-Lafourcade BM, Telles JN, Rajoharison A, Makawa MS, Agbenoko K, Tamekloe S, Mueller JE, Tall H, Gessner BD, Paranhos-Baccalà G, Moïsi JC. Evaluation of chest radiography, lytA real-time PCR, and other routine tests for diagnosis of community-acquired pneumonia and estimation of possible attributable fraction of pneumococcus in northern Togo. Epidemiol Infect. 2017 Feb;145(3):583-594. doi: 10.1017/S0950268816002211. Epub 2016 Nov 17. PubMed PMID: 27852346; PubMed Central PMCID: PMC5244441.

Riou J, Ait Ahmed M, Blake A, Vozlinsky S, Brichler S, Eholie S, Boelle PY, Fontanet A; HCV epidemiology in Africa group. Hepatitis C virus seroprevalence in adults in Africa: a systematic review and meta-analysis. J Viral Hepat. 2016 Apr;23(4):244-55. doi: 10.1111/jvh.12481. Epub 2015 Oct 19. PubMed PMID: 26477881.

Cao-Lormeau VM, Blake A, Mons S, Lastère S, Roche C, Vanhomwegen J, Dub T, Baudouin L, Teissier A, Larre P, Vial AL, Decam C, Choumet V, Halstead SK, Willison HJ, Musset L, Manuguerra JC, Despres P, Fournier E, Mallet HP, Musso D, Fontanet A, Neil J, Ghawché F. Guillain-Barré Syndrome outbreak associated with Zika virus infection in French Polynesia: a case-control study. Lancet. 2016 Apr 9;387(10027):1531-1539. doi: 10.1016/S0140-6736(16)00562-6. Epub 2016 Mar 2. PubMed PMID: 26948433; PubMed Central PMCID: PMC5444521.

Rossignol L, Maugat S, Blake A, Vaux S, Heym B, Le Strat Y, Kernéis S, Blanchon T, Coignard B, Hanslik T. Risk factors for resistance in urinary tract infections in women in general practice: A cross-sectional survey. J Infect. 2015 Sep;71(3):302-11. doi: 10.1016/j.jinf.2015.05.012. Epub 2015 Jun 6. PubMed PMID: 26054878.

Grandesso F, Allan M, Jean-Simon PS, Boncy J, Blake A, Pierre R, Alberti KP, Munger A, Elder G, Olson D, Porten K, Luquero FJ. Risk factors for cholera transmission in Haiti during inter-peak periods: insights to improve current control strategies from two case-control studies. Epidemiol Infect. 2014 Aug;142(8):1625-35. doi10.1017/S0950268813002562. Epub 2013 Oct 11. PubMed PMID: 24112364.

Communications orales

Blake A, Njanpop-Lafourcade BM, Telles JN, Rojaharison A, Makawa MS, Agbenoko K, Tamekloe S, Mueller JE, Tall H, Gessner B, Paranhos-Baccala G, Moisi JC. Diagnostic value of the chest radiography and laboratory testing and attributable pneumococcal etiology in community acquired pneumonia in Tone district, Togo. Poster session presented at ISPPD9 2014. 9 th International Symposium on Pneumococci and Pneumococcal Diseases; 2014 Mar 9-13; Hyderabad, India. (Poster)

Blake A, Telles JN, Njanpop-Lafourcade BM, Makawa MS, Agbenoko K, Tamekloe S, Tall H, Gessner B,Paranhos-Baccala G, Moisi JC. Diagnostic value of real-time lytA PCR on whole blood for detecting pneumococcal pneumonia in Tone district, Togo. Poster session presented at: IMMEM-10 2013. 10 th International Meeting on Microbial Epidemiological Markers; 2013 Oct 2-3; Paris, France. (Poster)

Blake A, Rossignol L, Maugat S, Vaux S, Heym B, Le Strat Y, Blanchon T, Hanslik T, Coignard B. DRUTI (Drug Resistance in community Urinary Tract Infections) - Resistance aux antibiotiques des infections urinaires communautaires, France, 2012. Paper presented at: RICAI 2013. Proceedings of the 34th Reunion Interdisciplinaire de Chimiotherapie Anti-Infectieuse; 2013 Nov 21-22; Paris, France. French.(Oral)

Blake A, Buyck JF, Ankri J. Factors associated with positive impact of informal caregiving on physical and psychological well-being: evidence for gender differences. Paper presented at: VII IAGG 2011. Proceedings of the 7th International Association ofGerontology and Geriatrics; 2011 Apr 14-17; Bologna, Italy. (Oral)